Skalpakupunktur används vid neurologiska och motoriska besvär och behandlingsområdena relateras till hjärnans funktionella områden. Skalpnålar kan användas vid stroke, tillstånd med nedsatt motorik, rörelseproblem, domningar, skakningar, smärtor och även vid syn, hörsel och talproblem.
Nålarna sätts i linjer på huvudet som relateras till hjärnans områden, och man kombinerar med kroppsnålar. Ofta används även elakupunktur eller moxa. Patienten får ofta röra på den påverkade kroppsdelen under behandlingen.
Skalpakupunktur ses som ett komplement till ordinarie medicinsk behandling och rehabilitering, inte som ersättning.